virtuoso装载大的rdf文件的方法
本文详细介绍了将一个比较大的rdf文件装载到virtuoso数据库的过程。参考virtuoso网站的文档说明,通过实践,将一个大约4.6G左右的nt文件装载到virtuoso数据库中,用了大概6个多小时。参考网站:http://vos.openlinksw.com/owiki/wiki/VOS/VirtBulkRDFLoader
以下是具体的步骤。
一 准备条件
1 virtuoso的版本要求。Open source version 6.1.3以上或者commercial version 06.02.3129以上,这些版本有大文件装载函数(方法)。
2 在virtuoso.ini中设置参数”DirsAllowed”,设置完成后需要重新启动virtuoso。
参考:http://docs.openlinksw.com/virtuoso/dbadm/
参数设置的格式如下:
DirsAllowed = <path> [, <path>]
DirsDenied = <path> [, <path>]
<path> := <absolute_path> or <relative_path>
可以用下面的命令查看,在cmd中,进入bin目录,然后运行isql,可以进入sql命令模式。
SQL> select server_root (), virtuoso_ini_path ();
上面的命令可以查看服务器的工作目录和ini文件名称。
用以下命令查看DirsAllowed参数的情况
SQL> select cfg_item_value (virtuoso_ini_path (), 'Parameters',
'DirsAllowed');
这一步,我没有设置DirsAllowed,通过命令可以查看到vad目录。
3 合理配置virtuoso.ini,保证有足够的内存和其他系统资源。
参考:http://vos.openlinksw.com/owiki/wiki/VOS/VirtRDFPerformanceTuning
主要设置两个参数,NumberOfBuffers和MaxDirtyBuffers。不同的系统内存对应设置不同的参数值。
如下表所示:
System RAM | NumberOfBuffers? | MaxDirtyBuffers? |
2 GB | 170000 | 130000 |
4 GB | 340000 | 250000 |
8 GB | 680000 | 500000 |
16 GB | 1360000 | 1000000 |
32 GB | 2720000 | 2000000 |
48 GB | 4000000 | 3000000 |
64 GB | 5450000 | 4000000 |
比如,我的系统是16G内存,就需要把对应的NumberOfBuffers设置为1360000,MaxDirtyBuffers设置为1000000。
4 文件格式要求。
Virtuoso只支持一下格式。
.grdf | Geospatial RDF |
.nq | N-Quads |
.nt | N-Triples |
.owl | OWL |
.rdf | RDF/XML |
.trig | TriG |
.ttl | Turtle |
.xml | RDF/XML |
二 大文件加载的过程
1 准备三个文件,放到vad目录(也就是DirsAllowed的目录)。一个是数据源文件,比如my_data.nt,一个是对应的图文件,和数据源文件的名称相同后面加.graph。比如my_data.nt.graph。一个是公共的图文件,用来处理那些没有对应的图文件的数据源文件,名称为global.graph。
标准格式:
<source-file>.<ext>
<source-file>.<ext>.graph
global.graph
举例:
myfile.n3 ;; RDF data
myfile.n3.graph ;; Contains Graph IRI name into which RDF data from myfile.n3 will be loaded
global.graph ;; Contains Graph IRI name into which RDF data from any files that do not have a specific graph name file will be loaded
2 把图的标识名(the graph IRI)写到*.graph中。比如,图的标识名为:http://dbpedia.org,把http://dbpedia.org写到*.graph中。
3 注册要加载的文件。使用isql,进入到SQL命令中,运行合适的方法。比如
SQL> ld_dir ('/path/to/files', '*.n3', 'http://dbpedia.org');
ld_dir()里面的目录不包括子目录。ld_dir_all()命令包括所有的子目录。
4 用DB.DBA.load_list来查看注册的数据集装载情况和图标识名正在加载还是已经加载。ll_state字段有三个值:0表示数据集还没有加载;1表示数据集正在加载中;2表示数据集已经加载完成。如下所示
SQL> select * from DB.DBA.load_list;
ll_file ll_graph ll_state ll_started ll_done ll_host ll_work_time ll_error
VARCHAR NOT NULL VARCHAR INTEGER TIMESTAMP TIMESTAMP INTEGER INTEGER VARCHAR
_____________________________________________________________________________________________________________________________
./dump/d1/file1.n3 http://file1 2 2010.10.20 9:21.18 0 2010.10.20 9:21.18 0 0 NULL NULL
./dump/d2/file2.n3 http://file2 2 2010.10.20 9:21.18 0 2010.10.20 9:21.18 0 0 NULL NULL
./dump/file.n3 http://file 2 2010.10.20 9:21.18 0 2010.10.20 9:21.18 0 0 NULL NULL
3 Rows. -- 1 msec.
SQL>
5 最后,通过rdf_loader_run()命令完成大文件数据的加载。
命令如下:
SQL> rdf_loader_run();
该命令执行后,如果文件比较大,会是一个漫长的等待过程,耐心等待,可以先不管他,做其他的工作去吧。
漫长等待之后,如果装载成功,会有一个花费时间的显示。
通过以上操作,就可以完成数据的加载。