Spark1.4.1中sparkR的编译使用全过程
本文针对那些和我一样,对spark还挺熟悉但对R知之甚少甚至之前没听过的同学,在spark引入了sparkR后才开始零基础地开始学习使用。如果你本身对R和sparkR已经很熟悉了,就不用看了。
本文主要包含的内容:
- spark1.4.1编译
- sparkR使用环境配置
- sparkR的第一个例子
spark1.4.1编译
首先从spark官网下载spark1.4.0或者1.4.1的源码,并解压。 要使用sparkR,必须要先用带有sparkR的参数的编译命令,把sparkR编译到spark的tar包中。命令如下:
./make-distribution.sh --tgz -Pyarn -Phive -Psparkr -DskipTests -DHadoop.version=your version
比1.4版本前的编译命令,多了个“-Psparkr”,表示要把sparkR编译进去。(这里注意大小写)
sparkR使用环境配置
sparkR的运行需要依赖R语言环境。
如果通过某一台客户端向spark提交sparkR作业以及各项操作,那么只在本客户端机器上安装R环境后,可以并只可以通过yarn-client方式操作。 如果在整个spark的集群上都安装了R环境,则可以用yarn-cluster或者yarn-client方式提交。其实很好理解,driver在哪里启动,就需要哪里有R环境。yarn-client模式中,driver在客户端本地启动,所以只需要本地有R环境;要运行yarn-cluster模式,driver就需要在spark集群的某个节点启动,该节点是不确定的,所以需要整个spark集群有R环境。(本段是我的个人理解,并不一定正确,欢迎指正。)
R环境的安装配置,我是用rpm包安装的。
1. 从http://mirror.utexas.edu/epel/6/x86_64/ 下载如下这些包:
libRmath-3.2.1-1.el6.x86_64.rpm
libRmath-devel-3.2.1-1.el6.x86_64.rpm
R-core-3.2.1-1.el6.x86_64.rpm
R-core-devel-3.2.1-1.el6.x86_64.rpm
R-java-3.2.1-1.el6.x86_64.rpm
R-java-devel-3.2.1-1.el6.x86_64.rpm
R-3.2.1-1.el6.x86_64.rpm
R-devel-3.2.1-1.el6.x86_64.rpm
2. 对上述8个rpm包,依次执行 yum install ..... 注意,因为有依赖关系,要按照我上面的这个顺序依次安装。例如:
yum install libRmath-3.2.1-1.el6.x86_64.rpm
sparkR的第一个例子
现在确保你的spark集群满足这两个条件:
1. 使用的spark是已经把sparkR编译进来了的版本;
2. 准备操作sparkR的这台机器上有R环境。
两种运行sparkR的方法:
1. spark-shell方式:
sparkR --master yarn-client
2. 提交作业的方法
spark-submit --master yarn-client your-r-file.R
下面的一个R文件,是我从Github上抄过来的一个例子,可惜已经找不到github上的链接了,只能遥遥感谢这个example的作者了。用上面两种运行方法,可以直接拷贝到一个R文件中,并spark-submit提交;也可以启动一个sparkR的shell客户端,然后逐行输入。