Pandas之旅(二): 有关数据清理的点点滴滴
数据清洗
大家好,这一期我将为大家带来我的pandas学习心得第二期:数据清理。这一步非常重要,一般在获取数据源之后,我们紧接着就要开始这一步,以便为了之后的各种操作,简单来说,我们的目标就是让数据看起来赏心悦目,规规矩矩的,所以我们会对原始的dataframe做一些必要的美容,包括规范命名,去除异常值,重新选择合适的index啊,处理缺失值,统一列的命名等等。
这一期我会和大家分享一些比较好用常见的清洗方法。首先还是让我们来简单看一下本文将会用到的数据源:
- property_data.csv 这是一个超小型的房地产行业的数据集,大家会在文章最后找到下载地址。
这篇文章我会从以下几个方面来和大家分享我的心得体会:
- 有关缺失值的处理
- 有关列的处理
- 设置Index
- 源码及数据下载地址
1.有关缺失值的处理
这里我们会用到 property_data.csv这个数据集,在开始处理缺失值之前,我们可以先话一分钟仔细想想,为什么实际生活中的数据从来是不完整的,原因基本有几个方面:
- 用户忘记填写字段
- 从旧数据库手动传输时数据丢失
- 代码中有bug
- 用户不填写非必须字段(比如注册的时候)
因为这些原因,我每次在处理missing value的时候都会问自己两个基础问题:
- 数据集每一列有什么特点?
- 我们想要在处理后得到什么类型的数据(int,float,string,boolean)?
带着这些疑问,我们可以开始了,首先让我们简单读取一下数据,利用head函数看看前5行,如果你还对pandas的基础知识有疑问,可以看看我上一篇文章:Pandas之旅(一): 让我们把基础知识一次撸完,申精干货
import pandas as pd import numpy as np import os os.chdir("F:\\Python教程\\segmentfault\\pandas_share\\Pandas之旅_02 数据清洗")
# Read csv file into a pandas dataframe df = pd.read_csv("property_data.csv") # Take a look at the first few rows df.head()
PID | ST_NUM | ST_NAME | OWN_OCCUPIED | NUM_BEDROOMS | NUM_BATH | SQ_FT | |
---|---|---|---|---|---|---|---|
0 | 100001000.0 | 104.0 | PUTNAM | Y | 3 | 1 | 1000 |
1 | 100002000.0 | 197.0 | LEXINGTON | N | 3 | 1.5 | -- |
2 | 100003000.0 | NaN | LEXINGTON | N | NaN | 1 | 850 |
3 | 100004000.0 | 201.0 | BERKELEY | 12 | 1 | NaN | 700 |
4 | NaN | 203.0 | BERKELEY | Y | 3 | 2 | 1600 |
现在让我们看看数据的一些关键列是什么:
- ST_NUM:街道号码
- ST_NAME: 街道名称
- OWN_OCCUPIED: 是否用于自住
- NUM_BEDROOMS:卧室数量
- SQ_FT:面积
这里可以给大家普及点房地产知识,有的时候房屋用途被明确规定,比如有的房产写的是"owner occupied only ")意思是说如果你买了,那这个房子会成为你的主要住所,不能用于出租之类的,简单理解就是自住
所以现在我可以自问自答第一个问题:数据集每一列有什么特点?
- ST_NUM:float或int ...
- ST_NAME:string
- OWN_OCCUPIED:string ... Y(“是”)或N(“否”)
- NUM_BEDROOMS:float或int,数字类型
- SQ_FT:float或int,数字类型
1.1 规范的缺失值标记
现在让我们关注ST_NUM这一列:
# Looking at the ST_NUM column df['ST_NUM']
0 104.0 1 197.0 2 NaN 3 201.0 4 203.0 5 207.0 6 NaN 7 213.0 8 215.0 Name: ST_NUM, dtype: float64
如果想查看该列的缺失值情况,我们可以利用isnull()方法,如果出现缺失值,会返回True,反之返回false
df['ST_NUM'].isnull()
0 False 1 False 2 True 3 False 4 False 5 False 6 True 7 False 8 False Name: ST_NUM, dtype: bool
但是其实如果我们打开csv文件,你会发现第3行是空白,还有一行在该列显示的是NA,所以结论已经有了:在pandas里表示缺省值的符号及时NA,换句话说,如果我们要表示缺省值,标准写法是NA
1.2 不规范的缺失值标记
同样的,这回让我们关注一下NUM_BEDROOMS这一列,我们发现出现了4种类型的表达缺省值的标记:
- n/a
- NA
- —
- na
通过刚才的实践,我们已经确定NA是pandas可以识别的,那么其他的符号呢,现在让我们来测试一下
df['NUM_BEDROOMS']
0 3 1 3 2 NaN 3 1 4 3 5 NaN 6 2 7 1 8 na Name: NUM_BEDROOMS, dtype: object
df['NUM_BEDROOMS'].isnull()
0 False 1 False 2 True 3 False 4 False 5 True 6 False 7 False 8 False Name: NUM_BEDROOMS, dtype: bool
可以看到pandas识别了n/a 和NA两种符号,但是接下来我们要考虑一个问题,假设你是房地产公司的地区总经理,你每周会收到不同地区的负责人提交的表格,
这些人中有的喜欢用--表示空白值,有的人喜欢用na,那应该怎么办?
最简单的方式就是将所有表示空白值的符号统一放在list中,让后让pandas一次性识别:
# Making a list of missing value types missing_values = ["na", "--"] df = pd.read_csv("property_data.csv", na_values = missing_values)
现在我们来看看到底发生了什么?
df
PID | ST_NUM | ST_NAME | OWN_OCCUPIED | NUM_BEDROOMS | NUM_BATH | SQ_FT | |
---|---|---|---|---|---|---|---|
0 | 100001000.0 | 104.0 | PUTNAM | Y | 3.0 | 1 | 1000.0 |
1 | 100002000.0 | 197.0 | LEXINGTON | N | 3.0 | 1.5 | NaN |
2 | 100003000.0 | NaN | LEXINGTON | N | NaN | 1 | 850.0 |
3 | 100004000.0 | 201.0 | BERKELEY | 12 | 1.0 | NaN | 700.0 |
4 | NaN | 203.0 | BERKELEY | Y | 3.0 | 2 | 1600.0 |
5 | 100006000.0 | 207.0 | BERKELEY | Y | NaN | 1 | 800.0 |
6 | 100007000.0 | NaN | WASHINGTON | NaN | 2.0 | HURLEY | 950.0 |
7 | 100008000.0 | 213.0 | TREMONT | Y | 1.0 | 1 | NaN |
8 | 100009000.0 | 215.0 | TREMONT | Y | NaN | 2 | 1800.0 |
我们可以发现只要missing_value中记录的表达空白值的符号,全部变成了规整的NaN
1.3 类型不一致的异常值
刚刚我们已经简单了解了在pandas中如何处理缺失值的,还有一种情况,让我们来看OWN_OCCUPIED这一列,这一列的答案只能是Y,N 但是我们发现数据集意外地出现了12,属于类型不对称
df['OWN_OCCUPIED'].isnull()
0 False 1 False 2 False 3 False 4 False 5 False 6 True 7 False 8 False Name: OWN_OCCUPIED, dtype: bool
现在我们发现12是异常值,因为它是类型错误,所以我们可以简单通过下面这个方法来检测,
# Detecting numbers cnt=0 for row in df['OWN_OCCUPIED']: try: int(row) df.loc[cnt, 'OWN_OCCUPIED']=np.nan except ValueError: pass cnt+=1
我们这里的策略是:
- 循环遍历OWN_OCCUPIED列
- 尝试将条目转换为整数
- 如果条目可以更改为整数,请输入缺失值
- 如果数字不能是整数,我们知道它是一个字符串,所以继续
这样我们会把OWN_OCCUPIED这一列中所有类型不对的值转化为NaN,现在来看结果:
df['OWN_OCCUPIED']
0 Y 1 N 2 N 3 NaN 4 Y 5 Y 6 NaN 7 Y 8 Y Name: OWN_OCCUPIED, dtype: object
1.4 汇总缺失值
pandas提供了更为简洁的方式,可以让我们整体了解所有column的空值:
df.isnull().sum()
PID 1 ST_NUM 2 ST_NAME 0 OWN_OCCUPIED 2 NUM_BEDROOMS 3 NUM_BATH 1 SQ_FT 2 dtype: int64
或者如果我们只想知道数据是否存在空值,那么可以使用以下的命令:
# Any missing values? df.isnull().values.any()
True
1.5 替换缺失值
如果我们想要替换掉缺失值,可以用fillna方法
# Replace missing values with a number df['ST_NUM'].fillna(125, inplace=True)
或者我们可以通过准确定位来替换缺失值:
# Location based replacement df.loc[2,'ST_NUM'] = 125
替换缺失值的一种非常常见的方法是使用中位数:
# Replace using median median = df['NUM_BEDROOMS'].median() df['NUM_BEDROOMS'].fillna(median, inplace=True) df
PID | ST_NUM | ST_NAME | OWN_OCCUPIED | NUM_BEDROOMS | NUM_BATH | SQ_FT | |
---|---|---|---|---|---|---|---|
0 | 100001000.0 | 104.0 | PUTNAM | Y | 3.0 | 1 | 1000.0 |
1 | 100002000.0 | 197.0 | LEXINGTON | N | 3.0 | 1.5 | NaN |
2 | 100003000.0 | 125.0 | LEXINGTON | N | 2.5 | 1 | 850.0 |
3 | 100004000.0 | 201.0 | BERKELEY | NaN | 1.0 | NaN | 700.0 |
4 | NaN | 203.0 | BERKELEY | Y | 3.0 | 2 | 1600.0 |
5 | 100006000.0 | 207.0 | BERKELEY | Y | 2.5 | 1 | 800.0 |
6 | 100007000.0 | 125.0 | WASHINGTON | NaN | 2.0 | HURLEY | 950.0 |
7 | 100008000.0 | 213.0 | TREMONT | Y | 1.0 | 1 | NaN |
8 | 100009000.0 | 215.0 | TREMONT | Y | 2.5 | 2 | 1800.0 |
2. 有关列的处理
2.1 统一修改列名
现在假设因为一些需求,需要我们统一修改列名,把列名改为小写,我们可以结合列表推导式轻易实现
df.rename(str.lower, axis='columns',inplace =True) df.columns
Index(['pid', 'st_num', 'st_name', 'own_occupied', 'num_bedrooms', 'num_bath', 'sq_ft'], dtype='object')
或者需要把列名中的_改为-:
new_cols = [c.replace("_","-") for c in df.columns] change_dict =dict(zip(df.columns,new_cols)) df.rename(columns=change_dict,inplace=True) df
pid | st-num | st-name | own-occupied | num-bedrooms | num-bath | sq-ft | |
---|---|---|---|---|---|---|---|
0 | 100001000.0 | 104.0 | PUTNAM | Y | 3.0 | 1 | 1000.0 |
1 | 100002000.0 | 197.0 | LEXINGTON | N | 3.0 | 1.5 | NaN |
2 | 100003000.0 | 125.0 | LEXINGTON | N | 2.5 | 1 | 850.0 |
3 | 100004000.0 | 201.0 | BERKELEY | NaN | 1.0 | NaN | 700.0 |
4 | NaN | 203.0 | BERKELEY | Y | 3.0 | 2 | 1600.0 |
5 | 100006000.0 | 207.0 | BERKELEY | Y | 2.5 | 1 | 800.0 |
6 | 100007000.0 | 125.0 | WASHINGTON | NaN | 2.0 | HURLEY | 950.0 |
7 | 100008000.0 | 213.0 | TREMONT | Y | 1.0 | 1 | NaN |
8 | 100009000.0 | 215.0 | TREMONT | Y | 2.5 | 2 | 1800.0 |
这里我没有写的精简一些,反而是复杂了,主要是想让大家回忆起之前我分享的dict使用技巧中的内容,注意这里inplace=True,导致的结果是我们的的确确修改了df所有的列名
2.1 根据需求新增列
假如目前我们需要新增一列,根据房屋面积大小来赋值,我们先随意把缺失值补上:
df['sq-ft'].fillna('0.0')
0 1000 1 0.0 2 850 3 700 4 1600 5 800 6 950 7 0.0 8 1800 Name: sq-ft, dtype: object
然后新建一列rank来根据房屋面积大小赋值S=small,M=medium,B=big:
df["rank"]= pd.cut(df['sq-ft'], [0, 800, 1600, np.inf], labels=("S","M","B")) df
pid | st-num | st-name | own-occupied | num-bedrooms | num-bath | sq-ft | rank | |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
0 | 100001000.0 | 104.0 | PUTNAM | Y | 3.0 | 1 | 1000.0 | M |
1 | 100002000.0 | 197.0 | LEXINGTON | N | 3.0 | 1.5 | NaN | NaN |
2 | 100003000.0 | 125.0 | LEXINGTON | N | 2.5 | 1 | 850.0 | M |
3 | 100004000.0 | 201.0 | BERKELEY | NaN | 1.0 | NaN | 700.0 | S |
4 | NaN | 203.0 | BERKELEY | Y | 3.0 | 2 | 1600.0 | M |
5 | 100006000.0 | 207.0 | BERKELEY | Y | 2.5 | 1 | 800.0 | S |
6 | 100007000.0 | 125.0 | WASHINGTON | NaN | 2.0 | HURLEY | 950.0 | M |
7 | 100008000.0 | 213.0 | TREMONT | Y | 1.0 | 1 | NaN | NaN |
8 | 100009000.0 | 215.0 | TREMONT | Y | 2.5 | 2 | 1800.0 | B |
具体实现方法我们之后会说,这里主要是用到了pandas的cut方法,非常便捷
3. 设置Index
在许多情况下,使用数据的唯一值标识字段作为其索引是有帮助的。这里可能我们的数据不太合适,因此我们先伪造一列Fake_Index来模拟真实场景中的真正索引
df["Fake_Index"]=["A00"+str(i) for i in range(len(df))] df
pid | st-num | st-name | own-occupied | num-bedrooms | num-bath | sq-ft | rank | Fake_Index | |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
0 | 100001000.0 | 104.0 | PUTNAM | Y | 3.0 | 1 | 1000.0 | M | A000 |
1 | 100002000.0 | 197.0 | LEXINGTON | N | 3.0 | 1.5 | NaN | NaN | A001 |
2 | 100003000.0 | 125.0 | LEXINGTON | N | 2.5 | 1 | 850.0 | M | A002 |
3 | 100004000.0 | 201.0 | BERKELEY | NaN | 1.0 | NaN | 700.0 | S | A003 |
4 | NaN | 203.0 | BERKELEY | Y | 3.0 | 2 | 1600.0 | M | A004 |
5 | 100006000.0 | 207.0 | BERKELEY | Y | 2.5 | 1 | 800.0 | S | A005 |
6 | 100007000.0 | 125.0 | WASHINGTON | NaN | 2.0 | HURLEY | 950.0 | M | A006 |
7 | 100008000.0 | 213.0 | TREMONT | Y | 1.0 | 1 | NaN | NaN | A007 |
8 | 100009000.0 | 215.0 | TREMONT | Y | 2.5 | 2 | 1800.0 | B | A008 |
现在我们添加的最后一列非常像真正的房屋Id了,让我们来看看这个伪造的索引是不是唯一值,可以利用is_unique来检验:
df.Fake_Index.is_unique
True
没有问题,现在我们可以放心地把这列设置为我们真正的索引:
df = df.set_index('Fake_Index') df
pid | st-num | st-name | own-occupied | num-bedrooms | num-bath | sq-ft | rank | |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Fake_Index | ||||||||
A000 | 100001000.0 | 104.0 | PUTNAM | Y | 3.0 | 1 | 1000.0 | M |
A001 | 100002000.0 | 197.0 | LEXINGTON | N | 3.0 | 1.5 | NaN | NaN |
A002 | 100003000.0 | 125.0 | LEXINGTON | N | 2.5 | 1 | 850.0 | M |
A003 | 100004000.0 | 201.0 | BERKELEY | NaN | 1.0 | NaN | 700.0 | S |
A004 | NaN | 203.0 | BERKELEY | Y | 3.0 | 2 | 1600.0 | M |
A005 | 100006000.0 | 207.0 | BERKELEY | Y | 2.5 | 1 | 800.0 | S |
A006 | 100007000.0 | 125.0 | WASHINGTON | NaN | 2.0 | HURLEY | 950.0 | M |
A007 | 100008000.0 | 213.0 | TREMONT | Y | 1.0 | 1 | NaN | NaN |
A008 | 100009000.0 | 215.0 | TREMONT | Y | 2.5 | 2 | 1800.0 | B |
现在对数据的操作容易多了,我们很多事情可以通过索引完成:
# 根据索引名称切片 df['A000':'A003']
pid | st-num | st-name | own-occupied | num-bedrooms | num-bath | sq-ft | rank | |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Fake_Index | ||||||||
A000 | 100001000.0 | 104.0 | PUTNAM | Y | 3.0 | 1 | 1000.0 | M |
A001 | 100002000.0 | 197.0 | LEXINGTON | N | 3.0 | 1.5 | NaN | NaN |
A002 | 100003000.0 | 125.0 | LEXINGTON | N | 2.5 | 1 | 850.0 | M |
A003 | 100004000.0 | 201.0 | BERKELEY | NaN | 1.0 | NaN | 700.0 | S |
# 根据索引位置切片 df.iloc[1:3, 0:3]
pid | st-num | st-name | |
---|---|---|---|
Fake_Index | |||
A001 | 100002000.0 | 197.0 | LEXINGTON |
A002 | 100003000.0 | 125.0 | LEXINGTON |
# 定位到具体元素 df.iloc[1,2]
'LEXINGTON'
总结
我把这一期的ipynb文件和py文件放到了GIthub上,大家如果想要下载可以点击下面的链接:
- Github仓库地址: https://github.com/yaozeliang/pandas_share
这一期先讲到这里,希望大家能够继续支持我,完结,撒花
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